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Les développements de la science et de la technologie ont fait en sorte que la médecine des greffes est passée du statut de traitement expérimental à celui de traitement de routine pour certains patients. Plusieurs d’entre eux se voient maintenant offrir une chance de survie grâce à la médecine des greffes. Toutefois, le nombre d'organes disponibles pour les greffes est insuffisant. Cette pénurie a d’ailleurs incité plusieurs acteurs de partout dans le monde à envisager des stratégies afin de combler ce manque d'organes à des fins de transplantation. Que doit-on penser de la commercialisation des organes? Des critères qui guident l’attribution des organes? De la xénotransplantation? Du don entre personnes vivantes? Quelles valeurs ces enjeux éthiques interpellent-ils?
L'avis de la Commission, publié en 2004, traite des enjeux éthiques fondamentaux que soulèvent le don et la transplantation d’organes, notamment sur les principales stratégies envisagées afin de pallier la pénurie d’organes. Dans son avis intitulé Le don et la transplantation d'organes : dilemmes éthiques en contexte de pénurie, la Commission formule dix recommandations en ce qui a trait, entre autres, à l’anonymat du don cadavérique, aux critères de sélection des candidats à la greffe, à l’augmentation des dons entre vivants, aux donneurs cadavériques selon les critères de la mort par arrêt cardiorespiratoire et à la sensibilisation au don d'organes et à la xénotransplantation.
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